1238)、延应(1239)、仁治(1240)

    第88代

    后嵯峨天皇

    1220～1272

    1242～1246

    年号：仁治、宽元(1243)

    第89代

    后深草天皇

    1243～1304

    1246～1259

    年号：宽元、宝治(1247)、建长(1249)、康元(1256)、正嘉(1257)、正元(1259)

    第90代

    龟山天皇

    1259～1274

    年号：文应(1260)、弘长(1261)、文永(1264)

    第91代

    后宇多天皇

    1267～1324

    1274～1287

    年号：建治(1275)、弘安(1278)

    第92代

    伏见天皇

    1265～1317

    1287～1298

    年号：正应(1288)、永仁(1293)

    第93代

    后伏见天皇

    1288～1336

    1298～1301

    年号：正安(1299)

    第94代

    后二条天皇

    1285～1308

    1301～1308

    年号：乾元(1302)、嘉元(1303)、德治(1306)

    第95代

    花园天皇

    1297～1348

    1308～1318

    年号：延庆(1308)、正和(1312)、文保(1317)

    第96代(南朝)

    后醍醐天皇

    1288～1339

    1318～1336

    年号：元应(1319)、元享(1321)、正中(1324)、元德(1329)、元弘(1331)、正庆(1332)、建武(1333)、延元(1336)。1333年灭北条氏，镰仓幕府终。1336年足利尊氏反，另立天皇，遂分南北朝，后醍醐天皇为南朝(1336～1392)

    第97代(南朝)

    后村上天皇

    1328～1368

    1339～1368

    年号：延元、兴国、正平

    第98代(南朝)

    长庆天皇

    1343～1394

    1368～1383

    年号：正平、建德(1370)、文中(1372)、天授(1375)、弘和(1381)

    第99代(南朝)

    后龟山天皇

    不详～1424

    1383～1392

    1391亡于北朝，年号：弘和、元中(1384)

    北朝第1代

    光严天皇

    1313～1364

    1331～1333

    北朝第2代

    光明天皇

    1321～1380

    1336～1348

    年号：建武(1336)、历应(1338)、康永、贞和。足利尊氏建立室町幕府(1338)

    北朝第3代

    崇光天皇

    1348～1351

    年号：贞和、观应(1350)

    北朝第4代

    后光严天皇

    1338